در دنیایی که شیمی و جادو در آن آمیخته شده است، دو برادر به نام‌های ادوارد و الفونسو الریک، دست به آزمایشی خطرناک می‌زنند تا مادرشان را که به تازگی از دنیا رفته است، زنده کنند. اما این آزمایش به طرز غم‌انگیزی به شکست می‌انجامد و جسم ادوارد مورد آسیب جدی قرار می‌گیرد و الفونسو نیز ناپدید می‌شود. حالا ادوارد با بازوی مکانیکی و الفونسو که روحش درون زرهی محبوس شده، در جستجوی چشمه فلسفه، یک شی جادویی قدرتمند، هستند تا جبران اشتباه خود را بکنند و خانواده خود را دوباره به هم پیوند بزنند.

در این داستان، شخصیت‌های مختلف با انگیزه‌های متفاوت درگیر ماجراجویی‌ها و اتفاقات غیرقابل پیش‌بینی می‌شوند. برخی به دنبال قدرت جاودانگی هستند، برخی در پی انتقام و برخی دیگر فقط می‌خواهند زنده بمانند. در این میان، شیمی‌دانان با تلاش برای ایجاد اکسیر جاودانگی، تعادل و آرامش را در این دنیای آشفته به خطر می‌اندازند.

هنگامی که ریمورو و دوستانش در یک توطئه با دختری با قدرت مرموز درگیر می‌شوند، فرمانده ریمورو و بنیمارو با غولی به نام هیرو برخورد می‌کنند که یکی از شاخ هایش شکسته است و شمشیر بلندی به اندازه خودش حمل می‌کند. هیرو یک بازمانده از دهکده اوگر است و زمانی برادر بزرگ بنیمارو و دوستانش بود و ...

یک دانشجوی کالج توکیو توسط غول مورد حمله قرار میگیرد، این موجود یک نوع انسان قدرتمند هست که از بدن انسان تغذیه می کند. او زنده میماند اما حالا در حال تبدیل شدن به همان موجود هست…

داستان فیلم به Deku و All Might میپردازد که به جزیره ی شناور دست ساز بشر برای یک نمایش عجیب سفر میکنند که جزیره هک میشود و ساکنان جزیره گروگان گرفته میشوند...